假设推理要以人们已有的知识为基础，通过对一些新产生的事物或与不同于平常的事物、事件等进行观察分析，从而对其可能拥有的性质进行假设，然后用假设的原理对其加以说明。生活中，人们在进行假设推理时往往不会注重假设的真实性和可能性，所以有很多时候会出现许多令人听过后啼笑皆非的假设推理，比如一名小孩子认为没有收到圣诞礼物的原因是圣诞老人的雪橇坏了，所以圣诞老人没办法来给他送礼物；一位女子认为男友没有接她的电话一定是不爱她了，而事实上她的男友只是在开会不方便接电话而已。
对于FBI来说，即使只是假设，也要有一定的科学依据。在FBI所有的假设推理中，所针对的对象都是已经存在的或可能存在的，比如与案件有关的人，与受害人有关的人，与案发现场有关的人等，类似外星人、圣诞老人、神灵之类的假设是绝对不会出现在他们的假设推理中的。他们会根据已获得的证据推测某个对象是否有可能存在，而不会仅凭想象将某个完全不可能存在的对象牵扯到假设推理中。
所有的假设推理都要有一定的依据，比如在对犯案过程的假设推理中，如果现场有人死亡，死者手中有非死者本人的头发，指甲缝里有非死者本人的皮屑，并且现场很乱，原本放在柜上的花瓶摔碎在地上，那么便可以假设推理出现场曾发生过一场激烈的打斗，死者在打斗的过程中曾拉扯过凶手的头发或抓伤过凶手。在这场假设推理的过程中，死者手中的头发、死者指甲缝里的皮屑、地上花瓶的碎片、柜上原有的与花瓶底大小形状相同的印迹都是假设推理的依据，有了这些依据，所进行的假设推理才显得合情合理。